秦岭国家植物园是由陕西省人民政府、国家林业和草原局、中国科学院和西安市人民政府联合共建的综合性大型植物园，是国内目前面积最大、地理位置最独特、生态价值最高，原始山林保护最好的植物园，也是全国唯一冠以“国家”二字的植物园。
园区位于秦岭中段的周至县境内，距离西安市70公里。规划面积639平方公里，西起黑河，东至周至与户县县界，北起省道S107，南至秦岭梁。有高山、中山、低山、丘陵和平原五个地貌单元，相对高差最大2417米，气候垂直变化明显，自然资源丰富。园区内地貌单元多样，气候垂直变化明显，生物多样性极其丰富，有植物1641种，动物154种，昆虫2000余种。园区大峡谷、瀑布、古栈道等自然和人文景观保存完好，核心保护区域分布大片原始森林，完整的森林生态系统和第四纪冰川地貌遗迹景观交相辉映。
按陕政函[2007]142号文件关于《陕西省人民政府关于秦岭国家植物园总体规划的批复》文件，规划由植物迁地保护区、生物就地保护区、动物迁地保护区(历史文化保护区）和复合生态功能区四大部分构成。一期建有“一河两场三湖四馆六区十八园”。其中一河指田峪河流域的生态保护；两场指大门广场、停车场；三湖指翠湖、太极湖、枫叶湖；四馆指温室馆、标本馆、科普馆、古生物馆；六区指田峪湿地恢复区、水生植物区、花卉引种试验区、金牛坪游客接待区、殿镇小城镇区、首阳高山植物区等六个特色功能区；十八园指海棠园、竹园、槭树科园等植物专科专类园。
2000年6月，省长办公会议决定建设秦岭植物园。2006年10月10日，陕西省人民政府、国家林业局、中国科学院和西安市人民政府在北京召开会决定联合共建秦岭国家植物园。秦岭国家植物园的建设一直坚持“保护、研究、科普、利用”并举的方针，统一规划、统一管理、分步实施、统筹发展，努力把秦岭国家植物园打造成中国的一个绿色品牌和秦岭生态保护利用与示范的样板。
建园以来，陕西省人民政府和西安市人民政府在园区基础设施建设、移民搬迁等方面投资了数亿元人民币，国家林业局和中国科学院在项目和人才智力方面给予了相应支持，中国科学院还将秦岭国家植物园纳入全国五大核心植物园。全球环境基金（GEF）等国际组织对秦岭国家植物园建设也高度关注，2010年，项目获得了全球环境基金（GEF）500万美元的赠款及亚洲开发银行4000万美元的贷款，用于支持园区建设。
省委省政府高度重视秦岭国家植物园建设，2016年7月19日，胡和平省长主持召开专题会议听取并研究了秦岭国家植物园建设有关工作，会议明确要求加快秦岭国家植物园建设进度，确保2017年10月1日前一期项目开园运营。根据省委省政府的要求，今年3月份秦岭国家植物园新一届领导班子带领全园职工拉开了确保“十一”开园的序幕，按照省委“撸起袖子加油干，追赶超越新陕西”的要求，统一思想，提高认识，全园动员，科学谋划，倒排工期，克服困难，保重点，保工期，全面加快项目建设。目前，已初步建成“一河两场三湖四馆六区十八园”“美丽植物园”“人文植物园”盛景初现。
2017年9月27日盛大开园。
